1. 年份的干支推算：
2025年是农历癸巳年（蛇年），因此年份的干支为“癸巳”。
2. 月份、日期干支推算：
由于题目未给出具体的农历日期，这里无法直接推算出月份和日期的干支。通常需要查阅农历历书或使用现代科技手段进行转换。
3. 时辰的干支推算：
凌晨3点28分属于丑时，根据干支纪时法，可推算出该时辰的干支。具体地，丑时的干支需根据当年的干支纪日来确定。
综合以上信息，阳历2025年1月7日凌晨3点28分出生的秦姓女孩的生辰八字，需在知晓具体农历日期的基础上，方可准确推算。八字中包含了年、月、日、时的天干地支，反映了个人出生时的天时地利人和，在中国传统文化中被认为与个人的命运息息相关。
需注意，生辰八字仅是个人出生信息的记录方式之一，不应过度迷信或用于预测个人命运。每个人的命运受多种因素影响，包括但不限于家庭背景、教育经历、个人努力等。